蛋白组学技术在检测肾血管平滑肌脂肪瘤血清差异蛋白中的应用

基础医学与临床 ›› 2013, Vol. 33 ›› Issue (11): 1480-1483.

蛋白组学技术在检测肾血管平滑肌脂肪瘤血清差异蛋白中的应用

董德鑫,李汉忠,张玉石

中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院泌尿外科

收稿日期:2013-04-22 修回日期:2013-05-20 出版日期:2013-11-05 发布日期:2013-10-28
通讯作者: 李汉忠 E-mail:winterheartd@yahoo.com.cn
基金资助:
肾细胞癌血清蛋白指纹图谱模型的建立和应用研究

The application of proteomics in detecting differentially expressed proteins in serum of renal angiomyolipoma

Received:2013-04-22 Revised:2013-05-20 Online:2013-11-05 Published:2013-10-28

摘要/Abstract

摘要： 目的应用WCX磁珠联合MALDI-TOF MS 技术对肾血管平滑肌脂肪瘤进行血清差异蛋白实验，寻找显著性表达的差异蛋白，以提高肾血管平滑肌脂肪瘤的检出率。方法应用磁珠联合MALDI-TOF MS技术对肾血管平滑肌脂肪瘤血清进行差异蛋白研究，筛选出肾血管平滑肌脂肪瘤多个血清差异蛋白，并应用遗传算法建立诊断模型。结果筛选出肾血管平滑肌脂肪瘤与对照组之间差异蛋白峰142个, 具有较明显差异的蛋白峰13个（P<0.05）。利用ClinProTools2.2软件通过遗传算法优化选择，筛选出符合条件的15个差异蛋白峰建立诊断模型，交叉验证识别能力为100%。结论建立了肾血管平滑肌脂肪瘤血清差异蛋白的诊断模型，有助于提高肾血管平滑肌脂肪瘤的检出率。

关键词: 肾血管平滑肌脂肪瘤, 蛋白质组学, 磁珠, 血清, 诊断

Abstract: Objective The application of WCX magnetic beads combined with MALDI-TOF MS in detecting differentially expressed proteins in serum of renal angiomyolipoma can reduce the misdiagnosis rate. Methods WCX beads combined with MALDI-TOF MS technique in detecting differentially expressed proteins in serum of renal angiomyolipoma can screen out differentially expressed proteins. And genetic algorithm was utilized to establish a diagnosis model. Results The technique screened out 142 different protein, and 13 were significantly different (P<0.05). ClinProTools2.2 software was utilized with genetic algorithm to screen out 15 differentially expressed proteins to establish a diagnosis model. The recognition rate was 100%. Conclusions The iagnosis model established by the application of WCX magnetic beads combined with MALDI-TOF MS can reduce the misdiagnosis rate of renal angiomyolipoma.

Key words: renal angiomyolipoma, proteomics, bead, serum, diagnosis

董德鑫李汉忠张玉石. 蛋白组学技术在检测肾血管平滑肌脂肪瘤血清差异蛋白中的应用[J]. 基础医学与临床, 2013, 33(11): 1480-1483.

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